L'Arciconfraternita non conosce difficoltà di rilievo fino ai primi decenni del XVIII secolo, quando i Gesuiti fanno pressione sul Papa per avere la chiesa di San Macuto, necessaria al Seminario da loro diretto. I tentativi per allontanare il Sodalizio ottengono l'effetto desiderato.
Tuttavia, l'Arciconfraternita riceve alcune contropartite: i Gesuiti sono obbligati a corrispondere un indennità di esproprio, ma soprattutto è assegnato all'associazione l'edificio in Via di Pietra con l'annessa chiesa di Santa Maria della Pietà.